高壓均質腔依據內部結構細節上的不同，可以分為三種類型：穴蝕噴嘴型；碰撞閥體型；Y形交互型。
一、穴蝕噴嘴型
穴蝕噴嘴型是最早的微射流均質產品，直接引用了高壓切割和航空航天推進技術中的氣蝕噴嘴結構，但是由于在超高壓(310MPa)的作用下，物料溶液經過孔徑很微小的閥心時會產生幾倍音速的速度，并與閥心內部結構發生激烈的磨擦與碰撞，因此其使用壽命較短并伴隨有不銹鋼微粒殘落。
二、碰撞閥體型
碰撞閥體型高壓均質腔通過碰撞閥（Impact valve）和碰撞環（Impact ring）結構的引入，降低了局部磨損，延長了均質腔的使用壽命。但是由于其根本原理上還是通過溶液中的物料和不銹鋼結構碰撞，所以不銹鋼微粒的磨損殘落問題沒有徹底解決。
碰撞型在后期發展中為了避免金屬微粒殘落和使用壽命較短的問題，在制作噴嘴和閥體時進一步采用了特殊質地的高硬度非金屬材料，如鉆石，藍寶石，納米陶瓷等。新型材料的應用使上述兩個問題得到了改善，但同時也增加了加工難度和制造成本。
三、Y形交互型
Y形交互型與上述兩種的根本區別在于其應用了對射流的原理。利用特有的Y形結構，使高壓溶液中高速運動的物料自相碰撞，大大提高了腔體的使用壽命，并解決了金屬微粒殘落的問題。

第一代碰撞型均質腔在生產醫用注射液時，殘落的惰性金屬顆粒有可能發生聚集或形成更大顆粒。從病理學角度看，將導致毛細血管血流減少，進而引發人體內組織的機械性損傷，以及引起急性或慢性炎癥反應。對射型均質腔的誕生從原理上解決了惰性金屬殘落的問題。

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